No varavīksnenes krāsu nosaka ar iedzimtību. Mūsdienu pasaulē, tumši eyed cilvēki daudz vairāk nekā gaismas acīm. Tas ir saistīts ar dominances ģenētisko īpašību, kas ir atbildīga par augsta līmeņa melanīnu. Tādēļ, bērni ar vecākiem, vienu spilgti-eyed, un otra - tumši acīm, būs, visticamāk, tumši eyed.
In zilām acīm varavīksnenes ārējās šķiedras raksturo zemu blīvumu un zemu saturu melanīna, šķiedru un iekšējo slāni atšķiras tumši zilā krāsā. Varavīksnenes kļūst zils, ja bālgans šķiedrām augšējā slānī ir izvietotas blīvi un "atšķaidīta" zilā krāsa zemākajos slāņos varavīksnene. Pelēkas acis strukturāli līdzīgas zils, bet blīvums šķiedru virspuse ir augstākas. Turklāt pelēkas acis bieži vien var būt apgabali ar dažādu melanīna saturu: zaļās, dzeltenās un brūnās svītras. Šajā gadījumā, acu krāsu nosaka, kāda krāsu toni dominē varavīksnenes dienasgaismā.
Zaļā krāsa varavīksnenes bieži ir saistīta ar sarkanu matu gēnu. Tas caurs raksturots acu krāsu vai gaiši dzeltenīgi brūna iris šķiedras ārējais slānis, kas kombinācijā ar iekšējo slāni dod zilā zaļā krāsā. Hazel un brūnas acis, dažreiz sauc par dzintara ir reti, un atšķirīgi izplatība ārējā slāņa varavīksnenes par tuvu novietotas šķiedru dzeltenās un brūnās. Iris lazda krāsu piesātināts melanīnu. Vairāk melanīna ietverta augšējos šķiedrās varavīksnenes un stingrāka viņi ir, tumšāku varavīksnene, bet tā krāsa ir brūna un nekad iet uz melna.